Het gemaal Eemnes is in 1993 gesticht nabij het voormalige stoomgemaal van de polder. Dit in 1883 gebouwde stoomgemaal en de naastgelegen Eemnessersluis hebben een belangrijke rol gespeeld in de geschiedenis van Eemnes en de waterhuishouding van het omliggende gebied. Al ver vóór de bouw van het gemaal werd het overtollige water afgevoerd via verschillende afwateringssluisjes, waaronder de Eemnessersluis, die in 1650 werd aangelegd. Door de voortdurende inklinking van het land en dalende waterpeilen werd de natuurlijke afwatering echter steeds moeilijker. Om dit probleem op te vangen werd in 1791 naast de sluis een watermolen gebouwd. Ook deze voorziening bleek op den duur onvoldoende capaciteit te hebben. Daarom verrees in 1883, op de plaats van de watermolen en direct naast de sluis, een stoomgemaal met twee schepraderen en een bijbehorende machinistenwoning.

In 1921 onderging het gemaal een ingrijpende modernisering. Onder leiding van de firma W.C. en K. de Wit werd de installatie geëlektrificeerd. Daarbij werden twee horizontale schroefpompen van het fabrikaat Pannevis geplaatst, elk met een gezamenlijke capaciteit van 80 m³ per minuut bij een opvoerhoogte van 1,00 meter. De aandrijving vond plaats door EMF-Dordt sleepringelektromotoren met een vermogen van 60 kW.

Een volgende stap in de ontwikkeling volgde in 1993. Toen werd de bemaling overgenomen door het hier besproken, nieuwe ondergrondse gemaal, met daarin twee elektrisch aangedreven KSB-onderwaterpompen, elk met een capaciteit van 67 m³ per minuut en aangedreven door elektromotoren. Deze pompen werden ondergebracht in een nieuw gebouwde pompkelder. De pompen werden in 2012 gerenoveerd door Bosman.

Hoewel de bemalingsfunctie inmiddels door de moderne installatie wordt vervuld, is veel van de historische techniek bewaard gebleven. De oorspronkelijke pompen, aandrijvingen, hulpwerktuigen en elektrische voorzieningen, waaronder de aanzetinrichting, bevinden zich nog altijd in het oude gemaalgebouw. Na een volledige restauratie in 2005-2006 verkeert het complex in uitstekende staat. Bijzonder is dat één van de oorspronkelijke pompen nog steeds operationeel is en daarmee een tastbaar onderdeel vormt van het industriële erfgoed van Eemnes.